Има различни устройства за синтез на пептидна библиотека, като Apex 396HT напълно автоматичен синтезатор на пептидна библиотека. Тези устройства могат автоматично да подготвят и нарязват пептидни библиотеки, като по този начин подобряват ефективността на синтеза и добива.