Влиянието на разтворителите върху разтворимостта на пептидите
Разтворимостта на пептидите се влияе от техния аминокиселинен състав. Хидрофобните аминокиселини като левцин (Leu), изолевцин (Ile) и валин (Val) правят пептидите хидрофобни, докато хидрофилните аминокиселини като лизин (Lys), хистидин (His), аргинин (Arg) правят пептидите хидрофилни. Следователно различните пептиди имат различна разтворимост поради разликите в състава им.
Ефектът на разтворителите върху стабилността на пептида
Реакция на дезаминиране
В реакцията на дезаминиране, хидролизата на аспарагин (Asn) и глутамин (Gln) остатъци образува аспарагинова киселина (Asp) и глутаминова киселина (Glu). Тези реакции могат да повлияят на стабилността на пептидите.
Окисляване
Пептидните разтвори са склонни към окисляване, което може да се дължи на замърсяване с пероксид в разтвора или спонтанно окисление на самия пептид. Окисляването не само засяга структурата на пептидите, но може също да доведе до загуба на тяхната функция.
Хидролиза
Пептидните връзки в пептидите лесно се хидролизират и разрушават, особено тези, образувани от Asp.
Грешка при образуване на дисулфидна връзка
Обменът между дисулфидни връзки или между дисулфидни връзки и тиолови групи може да доведе до образуването на неправилни дисулфидни връзки, водещи до промени в третичната структура и загуба на активност.
Рацемична реакция
С изключение на глицин (Gly), алфа въглеродните атоми на всички аминокиселинни остатъци са хирални и склонни към реакции на рацемизация при алкална катализа. Сред тях остатъците от аспарагинова киселина (Asp) са най-склонни към реакции на рацемизация.
- елиминиране
- елиминирането се отнася до елиминирането на функционални групи на въглеродния атом в аминокиселинните остатъци. Тази реакция е по-вероятно да се случи при алкално pH, а температурата и металните йони също оказват влияние върху нея.
Разтворете пептидите в екологично чисти разтворители
При разтваряне на пептиди може да се използва малко количество N-метилпиролидон (DMF) или диметилсулфоксид (DMSO) за подпомагане на разтварянето. Тези два разтворителя могат да насърчат разтварянето чрез разрушаване на вторичната структура на пептидите. Все пак трябва да се отбележи, че тези разтворители могат да повлияят на биологичната активност на пептидите и последващата изследователска работа, така че трябва да се внимава, когато се използват.
Заключение
В обобщение, екологични разтворители като DMF и DMSO могат да помогнат за разтварянето на пептидите чрез разрушаване на тяхната вторична структура, но тяхното използване може да окаже влияние върху структурата и биологичната активност на пептидите. Следователно, когато се избират и използват екологично чисти разтворители, е необходимо да се претегли тяхното въздействие върху пептидната структура и разтворимост, за да се гарантира стабилността и биологичната активност на пептидите.